科研平台
| 序号 | 名称 | 批准部门 | 批准时间 |
| 1 | 生态恢复与生态系统管理省部共建国家重点实验室培育基地 | 科技部 | 2003 |
| 2 | “食用菌新种质资源创制”国际联合研究中心 | 科技部 | 2017 |
| 3 | “菌类作物优质高产抗病种质资源挖掘、创制及应用”学科创新引智基地（“111”计划） | 教育部、 国家外国专家局 | 2017 |
| 4 | 现代农业技术国际合作联合实验室 | 教育部 | 2017 |
| 5 | 食药用菌教育部工程研究中心 | 教育部 | 2007 |
| 6 | 国家玉米工程中心（联合） | 国家发改委 | 2011 |
| 7 | 人参新品种选育与开发国家地方联合工程研究中心 | 国家发改委 | 2018 |
| 8 | 农业农村部北方食用菌资源利用重点实验室 | 农业农村部 | 2012 |
| 9 | 东北区域有害生物综合治理重点实验室（联合） | 农业农村部 | 2011 |
| 10 | 农业农村部农药登记田间药效试验资质单位 | 农业农村部 | 2015 |
| 11 | 吉林农业大学国家农作物品种审定特性鉴定站 | 农业农村部 | 2016 |
| 12 | 东北植物营养与农业环境重点实验室 | 农业农村部 | 2014 |
| 13 | 农业农村部(吉林)大豆区域技术创新中心 | 农业农村部 | 2006 |
| 14 | 农业农村部“吉林农业大学长春大豆农科教合作人才培养基地” | 农业农村部 | 2013 |
| 15 | 农业农村部农药登记(残留)试验单位 | 农业农村部 | 1999 |
| 16 | 食用菌科技创新中心平台 | 吉林省教育厅 | 2012 |
| 17 | 经济菌物吉林省高校高端科技创新平台 | 吉林省教育厅 | 2014 |
| 18 | 食药用菌产业化吉林省高等学校工程研究中心 | 吉林省教育厅 | 2007 |
| 19 | 吉林省食用菌科技创新中心 | 吉林省科技厅 | 2007 |
| 20 | 菌类药物实验室 | 吉林省中医药管理局 | 2003 |
| 21 | 天敌昆虫应用技术工程研究中心 | 吉林省教育厅 | 2011 |
| 22 | 农业现代化综合技术研究所 | 吉林省科技厅 | 1987 |
| 23 | 吉林省生物防治工程技术研究中心 | 吉林省科技厅 | 2017 |
| 24 | 吉林省资源昆虫产业化工程研究中心 | 吉林省发改委 | 2018 |